目前我國商業(yè)保理通常有兩種運行模式， 一種是由賣方發(fā)起的保理，其目的是對資金來源加以掌控。而這種保理模式控制流程與銀行保理一定相似性，盡管保理商會對賣方信息進行核定，但卻不能充分確保每個買方均有支付意愿及能力，據(jù)此，為消除個別買方存在的不確定性，保理商就必須從其他買方回款中來確保賬款自償性，以平衡或抵消個別買方的損失。 第二種模式則是由買方發(fā)起的保理，這種保理模式在銀行十分常見，很多銀行稱之為“反向保理”，這種模式比較容易控制銀行款的風險，不僅滿足了中小企業(yè)短期資金的需求，增強了中小企業(yè)的生產穩(wěn)定性和品質保證，而且有利于整個供應鏈的持續(xù)運作和價格競爭力。

為改善存在的諸多問題，為規(guī)范中小企業(yè)經(jīng)營，商業(yè)保理公司注冊應采取一些必要措施保護資產， 應激勵商業(yè)保理公司為中小企業(yè)融資，中小企業(yè)自己也要通過與商業(yè)保理公司合作，規(guī)范經(jīng)營，只有通過不斷的創(chuàng)新和改進，企業(yè)才能順應社會潮流發(fā)展，解決內部因素與外部因素產生的諸多問題，才能實現(xiàn)各方面利益的 大化。

商業(yè)保理業(yè)務的基礎是企業(yè)的履約能力，考核企業(yè)的履約能力的基礎又是建立在企業(yè)之間真實交易的基礎之上。所以，商業(yè)保理業(yè)務是目前推動商業(yè)領域信用體系建設的途徑。發(fā)達的社會主義市場經(jīng)濟就是信用經(jīng)濟。我國正處在經(jīng)濟轉型期，國內商業(yè)領域信用體系建設勢在必行，作為該體系建設的有力方式之一，社會需求決定商業(yè)保理應當盡快在我國推行。明確的社會價值，準確的社會定位將是商業(yè)保理行業(yè)發(fā)展的前提條件之一。

保理公司的監(jiān)管方面，內資保理公司由工商管理局直接核發(fā)執(zhí)照。外資保理公司由商委部門先進行前置審批（外商投資備案）、再由工商部門審批營業(yè)執(zhí)照。內外資保理公司雖然經(jīng)營范圍的表述不盡相同，但其實際經(jīng)營項目是一致的。