微生物實驗室主要是對微生物的分離、培養(yǎng)、育種、鑒別、形態(tài)、變異、利用、危害等方面進行實驗和研究，食品微生物實驗室主要檢測項目有：酵母、乳酸菌、雙歧桿菌、罐頭商業(yè)無菌、菌落總數(shù)、大腸菌群、霉菌、致病菌（如沙門氏菌、志賀氏菌、溶血性鏈球菌、金黃色葡萄球菌等），應該將實驗室建在遠離生活區(qū)，清潔安靜的場所；要與生產加工車間較近的距離，方便扦樣與檢驗。

為控制人員的出入（人流），只設有一個密封門進入微生物實驗室主潔凈區(qū)，操作人員進入物流走廊然后進入準備間，并從準備間分別經過一更、緩沖進入操作區(qū)；經過更衣、風淋、緩沖進入局部百級實驗室。物流則由六個傳遞窗實現(xiàn)。

整個平面布局完全能夠滿足國家相關規(guī)范及實驗室使用的要求，充分利用了空間，按照實驗操作流程配備了各種功能的房間，操作線路方便快捷。

為確保實驗室內的氣流由“清潔”區(qū)域流向“污染”區(qū)域，實驗室內不應使用雙側均勻分布的排風口布局。不應采用上送上排的通風設計。由生物柜排出的經內部過濾的空氣可通過系統(tǒng)的排風管直接排至大氣，也可送入建筑物的排風系統(tǒng)。應確保生物柜與排風系統(tǒng)的壓力平衡。

通風空調系統(tǒng)為直排系統(tǒng)，不得采用部分回風系統(tǒng)。實驗室的進風應經初、中、三級過濾。

實驗室的排風必須經過濾或加其他方法處理后，以不低于12m/s的速度直接向空中排放。該排風口應遠離系統(tǒng)進風口位置。處理后的排風也可排入建筑物的排風管道，但不得被送回到該建筑物的任何部位。