化糞池的清掏周期與糞便污水溫度、氣溫、建筑物性質(zhì)及排水水質(zhì)、水量有關。清掏周期過短，則化糞池糞液濃度過高，與實際清掏周期差距過大，影響正常發(fā)酵和污水處理效果，甚至造成糞液漫溢，影響環(huán)境衛(wèi)生。

運輸過程中產(chǎn)生二次污染。吸糞車的滴灑泄漏使臭氣蔓延。如果糞渣無出路，會發(fā)生清掏者隨意傾倒，糞渣的較終處置引起再次污染。

大部分化糞池很難做到定期清掏, 有的甚至十幾年從不清掏, 等到糞便溢漏才清理。因此, 造成大部分化糞池淪為“過流池”, 糞便幾乎不經(jīng)任何處理就排入下水道。

三格比例：一池和二池體積不同，對寄生蟲卵沉淀效果有一定影響。如果一池容積太小，糞便存放時間短，達不到糞便分解沉淀的目的，糞便和雞蛋可能進入二池，增加二池的負擔，容易造成糞便管堵塞。如果二池容積相對較小，糞便在二池停留時間較短，糞便無害化處理效果較差。

糞肥穿越管位置：糞肥穿越管的安裝位置與糞肥流向、流程長度、是否有利于厭氧處理、是否能有效阻擋糞肥皮和糞肥殘渣、維持一、二池有效容積有關。新鮮糞肥進入糞坑后，在上層集中形成糞皮，然后逐漸疏松崩解，以較大的比重下沉形成糞渣，糞皮與糞渣之間為稀糞液。