2016年，科技部、財政部、國稅總局聯合印發(fā)《高新技術企業(yè)認定管理辦法》（以下簡稱新辦法），并于2016年起實施。新辦法降低了高新技術企業(yè)認定指標，同時強化了事中事后的監(jiān)管力度，相比原辦法，新辦法更具有合理性和實用性。同時，自2018年至2021年三年的運行來看，國家對于高新技術企業(yè)一直采用寬進模式，所以，2022年國家高新技術企業(yè)認定的要求有望進一步降低！各位企業(yè)經營者們要抓住這個機會！
新辦法在人員和研發(fā)費用比例方面均做了調整，既考慮了大型企業(yè)的人員特點，又支持了中小企業(yè)的創(chuàng)新和發(fā)展。
（一）降低或取消科技人員和研發(fā)人員比例及學歷限制。
在人員比例方面，放寬對科技人員和研發(fā)人員比例的要求。新辦法由現行“科技人員占企業(yè)當年職工總數的30%以上”調整為“科技人員占企業(yè)當年職工總數的比例不低于10%”，同時取消了“大學?？埔陨蠈W歷”的限制和“研發(fā)人員占企業(yè)當年職工總數的10%以上”的規(guī)定。對于人數眾多的大型國企這無疑是個利好。
（二）減少研發(fā)費用總額占銷售收入比例檔次。
在研發(fā)費用總額占銷售收入比例方面，新辦法將“三檔”降為“兩檔”，以2億元為界限，2億以上比例不低于3%，2億元以下（含2億）比例不低于4%。取消5000萬元和6%比例檔次，意在支持中小企業(yè)的科技創(chuàng)新和發(fā)展。
二、申請高新技術企業(yè)認定或復審時都有哪些變化？
相比于原辦法，新辦法在申請資料及備案方面要求更加嚴謹；在認定程序方面更具有時效性；在監(jiān)管方面更具有合理性。
（一）準備申請資料方面：
新辦法第六條取消“獨占許可合同”字樣，增加“近三個會計年度企業(yè)所得稅年度納稅申報表”。同時要求企業(yè)歷年的納稅申報記錄與會計報表等提交資料應保證內在邏輯的一致性。為監(jiān)管機構的后續(xù)管理奠定了基礎。
（二）在年度備案方面：
新辦法第十三條增加企業(yè)獲得高新技術企業(yè)資格后，應每年4月底前在“高新技術企業(yè)認定管理工作網”填報上一年度知識產權、科技人員、研發(fā)費用、經營收入等年度發(fā)展情況報表。其要求與《國家稅務總局關于實施高新技術企業(yè)所得稅優(yōu)惠有關問題的通知》（國稅函【2009】203號文，以下簡稱203號文）第五條關于備案的內容要求上基本一致。因新辦法由三部委聯合發(fā)布，增加備案管理，在執(zhí)行力度上將高于203號文，使高新技術企業(yè)備案管理具有更高的法律地位。
（三）認定程序方面：
新辦法（三）規(guī)定：認定企業(yè)由領導小組辦公室在“高新技術企業(yè)認定管理工作網”公示10個工作日，無異議的，予以備案。相比于原辦法，公示日由15個工作日減少到10個工作日，增加了高新技術企業(yè)認定的時效性。
（四）監(jiān)管方面：
新辦法第十九條“取消高新技術資格的情形規(guī)定”中對“提供虛假信息”和“偷騙稅行為”增加“嚴重”定語，避免了原辦法對上述行為不區(qū)分情節(jié)嚴重，一刀切，處罰有失公平、公正原則。但如何界定“嚴重”，相信會在后續(xù)出臺的配套工作指引中加以明確，否則監(jiān)管機關在實操中會有很大的自由裁量權，容易產生爭議。特別需要強調的是，新辦法第十九條增加“累計兩年未填報年度發(fā)展情況報表的”將被取消高新技術企業(yè)資格，同時取消了“被取消資格的企業(yè)，認定機構在5年內不再受理該企業(yè)的認定申請”的規(guī)定
三、高新技術企業(yè)存在哪些潛在風險？
新辦法降低高新技術企業(yè)準入門檻的同時，加強了監(jiān)管力度，對于企業(yè)而言，由于受研發(fā)項目、技術產品（服務）先進性、財稅核算基礎以及內部監(jiān)管體系等諸多因素影響，可能導致高新技術企業(yè)資格認定被拒、補繳稅款及取消資格的風險。
（一） 研發(fā)項目不合規(guī)導致資格認定無法通過的風險。
目前，新辦法配套的工作指引尚未出臺，原高新技術認定辦法的工作指引《國科發(fā)（2008）362號》（以下簡稱362號文）對研發(fā)活動、研發(fā)項目的確認以及其他指標如核心自主知識產權、科研人員、銷售收入等有著明確嚴格的規(guī)定。一般來說，新辦法的工作指引變化不會太大。參照原辦法的工作指引，如果企業(yè)申請資格認定時，研發(fā)活動不是國家重點支持的高新技術領域內，或者其他內容任何一項指標不達標，都有可能面臨著高新資格認定未通過的風險。
（二） 指標核算口徑不規(guī)范引發(fā)監(jiān)管風險。
企業(yè)對高新認定各項指標理解各異，指標計算容易出現偏差，導致各項指標不能準確反映高新技術企業(yè)的研發(fā)收入及費用比例狀況。如新辦法第六條規(guī)定：近一年高新技術產品（服務）收入占企業(yè)同期總收入的比例不低于60%。根據國家稅務總局關于發(fā)布《中華人民共和國企業(yè)所得稅年度納稅申報表（A類，2014年版）》的公告、國家稅務總局公告2014年第63號（以下簡稱63號公告）中的A107041《高新技術企業(yè)優(yōu)惠情況及明細表》填報說明規(guī)定：企業(yè)同期總收入應為為稅法第六條規(guī)定的收入總額。包括：銷售貨物收入，提供勞務收入，轉讓財產收入，股息、紅利等權益性投資收益，利息收入，租金收入，特許權使用費收入，接受捐贈收入，其他收入。但部分企業(yè)認為總收入僅為主營業(yè)務收入和其他業(yè)務收入之和，直接導致的后果就是收入比例計算虛高，雖順利通過了高新資格認定，未來也面臨著嚴格的高新技術企業(yè)復核和稽查風險。
（三） 研發(fā)支出加計扣除依據不足存在補繳稅款風險。
財政部、國家稅務總局《關于完善研究開發(fā)費用稅前加計扣除政策的通知》（財稅（2015）119號文，以下簡稱119號文）及國家稅務總局《關于企業(yè)研究開發(fā)費用稅前加計扣除政策有關問題的公告》（國家稅務總局公告2015年第97號，以下簡稱97號公告）中明確規(guī)定了可加計扣除的研發(fā)費用。但仍有企業(yè)由于不熟悉政策，存在研發(fā)支出歸集不合理，加計扣除依據不足的現象。如97號公告規(guī)定，企業(yè)從事研發(fā)活動的人員和用于研發(fā)活動的儀器、設備、無形資產，同時從事或用于非研發(fā)活動的，應對其人員活動及儀器設備、無形資產使用情況做必要記錄