高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定申請工作概括起來大致分為四部分：明晰規(guī)定，熟悉程序，完善材料，網(wǎng)上操作。其中明晰規(guī)定是指申請企業(yè)應(yīng)當(dāng)認(rèn)真研讀《認(rèn)定辦法》、《工作指引》，結(jié)合自身情況認(rèn)真加以對照，作出是否符合要求或努力方向的準(zhǔn)確判斷。熟悉程序是指申請企業(yè)對高新技術(shù)企業(yè)的認(rèn)定與享受稅收優(yōu)惠的程序要清楚明了，不走彎路。完善材料是指申請企業(yè)在認(rèn)為自己符合認(rèn)定要求后，要對申請材料進行認(rèn)真準(zhǔn)備，力求完美。網(wǎng)上操作是指高新技術(shù)企業(yè)的認(rèn)定工作已有改變，不再是層級上報材料，而是直接在網(wǎng)上申請和提交材料。

高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定程序有五個環(huán)節(jié)，包括自我評價、注冊登記、準(zhǔn)備并提交材料、組織審查與認(rèn)定、公示及頒發(fā)證書。申請企業(yè)要完成的是前三項，其中材料準(zhǔn)備是重要的一項工作?！豆ぷ髦敢范?3)列舉了需要提交的材料種類，包括認(rèn)定申請書，兩個鑒證報告(近三個會計年度研究開發(fā)費用鑒證報告、近三個會計年度的財務(wù)報表鑒證報告含資產(chǎn)負(fù)債表、利潤及利潤分配表、現(xiàn)金流量表)(實際年限不足三年的按實際經(jīng)營年限)，一個審計報告(近一個會計年度高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入專項審計報告)，以及技術(shù)創(chuàng)新活動證明材料。

根據(jù)《工作指引》規(guī)定，企業(yè)申請高新技術(shù)企業(yè)的認(rèn)定申請書由《企業(yè)基本信息表》、《企業(yè)研究開發(fā)項目表》、《上年度高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))情況表》、《近三年內(nèi)獲得自主知識產(chǎn)權(quán)匯總表》、《企業(yè)年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細(xì)表》五種表格組成，在填表時要注意所有的財務(wù)數(shù)據(jù)都來自專項審計報告，要和鑒證報告、審計報告完全一致。其中《企業(yè)基本信息表》中“近三年內(nèi)獲得的自主知識產(chǎn)權(quán)數(shù)”一欄所填內(nèi)容，應(yīng)與技術(shù)創(chuàng)新活動證明材料一一對應(yīng)并完全吻合;“人力資源情況”欄要注意兩個比例要求，即大專以上學(xué)歷的科技人員要占(申請)當(dāng)年職工總數(shù)30%以上，研發(fā)人員占職工人數(shù)10%以上;