高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定專項(xiàng)審計(jì)，是指注冊(cè)會(huì)計(jì)師接受擬向有關(guān)部門申請(qǐng)進(jìn)行高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定的申報(bào)企業(yè)委托，對(duì)其近三個(gè)會(huì)計(jì)年度(實(shí)際經(jīng)營(yíng)不滿三年的按實(shí)際經(jīng)營(yíng)年限)的研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用結(jié)構(gòu)明細(xì)表和近一個(gè)會(huì)計(jì)年度的高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細(xì)表進(jìn)行審計(jì)，并出具專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告。

高新技術(shù)企業(yè)專項(xiàng)審計(jì)，是依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定辦法相關(guān)規(guī)定，對(duì)近三年的研發(fā)費(fèi)用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入情況進(jìn)行審計(jì)，出具審計(jì)專項(xiàng)報(bào)告。該報(bào)告主要用于企業(yè)申辦高新技術(shù)企業(yè)或高新技術(shù)企業(yè)復(fù)審使用。提供給科委、財(cái)政、稅務(wù)、工商單位及管理層和董事會(huì)等相關(guān)。

申報(bào)明細(xì)表與年度財(cái)務(wù)報(bào)表相關(guān)聯(lián)，是指企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用結(jié)構(gòu)明細(xì)表和近一年高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細(xì)表的相關(guān)數(shù)據(jù)包含在已審計(jì)的年度財(cái)務(wù)報(bào)表中，兩者適用的會(huì)計(jì)準(zhǔn)則或會(huì)計(jì)制度是一致的，在相關(guān)會(huì)計(jì)政策、會(huì)計(jì)估計(jì)方面不存在差異。

要求識(shí)別和評(píng)估申報(bào)明細(xì)表層次以及各類交易、列報(bào)認(rèn)定層次的重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)。申報(bào)明細(xì)表層次重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)需要從整體上加以判斷，比如，申報(bào)企業(yè)不能提供研究開(kāi)發(fā)項(xiàng)目的相關(guān)計(jì)劃與實(shí)施方案、研究開(kāi)發(fā)記錄，申報(bào)明細(xì)表整體上就可能存在重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)。申報(bào)明細(xì)表層次重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)很可能源于薄弱的控制環(huán)境，特別是凌駕于內(nèi)部控制制度之上時(shí)，很可能偽造或篡改編制申報(bào)明細(xì)表所依據(jù)的會(huì)計(jì)記錄或相關(guān)文件。