高新技術(shù)企業(yè)專項審計工作從業(yè)務(wù)承接到完成通常要經(jīng)過以下步驟：

1、會計師事務(wù)所和高新技術(shù)企業(yè)專項審計單位進行初步溝通了解，確定高新技術(shù)企業(yè)專項審計目的、審計范圍、審計收費等；并簽訂業(yè)務(wù)約定書；

2、會計師事務(wù)所安排項目組，下發(fā)委托方高新技術(shù)企業(yè)專項審計準(zhǔn)備的資料清單；

3、被審高新技術(shù)企業(yè)專項審計單位按照資料清單準(zhǔn)備相關(guān)審計資料，并確定現(xiàn)場審計時間。

4、現(xiàn)場審計階段；

5、審計情況匯總和形成審計報告初稿；

6、與被審高新技術(shù)企業(yè)專項審計單位交換意見；

7 、出具正式審計報告。

申報明細表又區(qū)別于年度財務(wù)報表。企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表和近一年高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細表是按照《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》和《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作指引》編制的，其列報的數(shù)據(jù)可以直接反映出企業(yè)是否滿足認(rèn)定條件。

要求針對研究開發(fā)項目和高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))了解申報企業(yè)及其環(huán)境，比如，了解申報企業(yè)產(chǎn)品(服務(wù))的技術(shù)變化，了解申報企業(yè)研究開發(fā)部門的設(shè)置和分布，以及是否存在專門的機構(gòu)和人員從事研究開發(fā)活動，了解申報企業(yè)為從事研究開發(fā)活動而進行的固定資產(chǎn)投入以及為這些投入而使用的資金的來源，了解申報企業(yè)是否確立了創(chuàng)建科技創(chuàng)新型企業(yè)的發(fā)展戰(zhàn)略，了解申報企業(yè)是否將高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入作為主要的業(yè)績考核指標(biāo)。

與高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入相關(guān)的內(nèi)部控制包含在企業(yè)產(chǎn)品或服務(wù)的銷售控制中，而如高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入與研究開發(fā)激勵或與銷售獎勵相關(guān)聯(lián)時，企業(yè)一般會設(shè)計或增加相應(yīng)的控制環(huán)節(jié)。注冊會計師審計時，需要了解申報企業(yè)能否確保銷售均已準(zhǔn)確記錄并對高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))進行恰當(dāng)分類。