高新技術(shù)企業(yè)專項(xiàng)審計(jì)，是依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定辦法相關(guān)規(guī)定，對近三年的研發(fā)費(fèi)用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入情況進(jìn)行審計(jì)，出具審計(jì)專項(xiàng)報(bào)告。該報(bào)告主要用于企業(yè)申辦高新技術(shù)企業(yè)或高新技術(shù)企業(yè)復(fù)審使用。提供給科委、財(cái)政、稅務(wù)、工商單位及管理層和董事會(huì)等相關(guān)。

高新技術(shù)企業(yè)專項(xiàng)審計(jì)工作從業(yè)務(wù)承接到完成通常要經(jīng)過以下步驟：

1、會(huì)計(jì)師事務(wù)所和高新技術(shù)企業(yè)專項(xiàng)審計(jì)單位進(jìn)行初步溝通了解，確定高新技術(shù)企業(yè)專項(xiàng)審計(jì)目的、審計(jì)范圍、審計(jì)收費(fèi)等；并簽訂業(yè)務(wù)約定書；

2、會(huì)計(jì)師事務(wù)所安排項(xiàng)目組，下發(fā)委托方高新技術(shù)企業(yè)專項(xiàng)審計(jì)準(zhǔn)備的資料清單；

3、被審高新技術(shù)企業(yè)專項(xiàng)審計(jì)單位按照資料清單準(zhǔn)備相關(guān)審計(jì)資料，并確定現(xiàn)場審計(jì)時(shí)間。

4、現(xiàn)場審計(jì)階段；

5、審計(jì)情況匯總和形成審計(jì)報(bào)告初稿；

6、與被審高新技術(shù)企業(yè)專項(xiàng)審計(jì)單位交換意見；

7 、出具正式審計(jì)報(bào)告。

要求針對研究開發(fā)項(xiàng)目和高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))了解申報(bào)企業(yè)及其環(huán)境，比如，了解申報(bào)企業(yè)產(chǎn)品(服務(wù))的技術(shù)變化，了解申報(bào)企業(yè)研究開發(fā)部門的設(shè)置和分布，以及是否存在專門的機(jī)構(gòu)和人員從事研究開發(fā)活動(dòng)，了解申報(bào)企業(yè)為從事研究開發(fā)活動(dòng)而進(jìn)行的固定資產(chǎn)投入以及為這些投入而使用的資金的來源，了解申報(bào)企業(yè)是否確立了創(chuàng)建科技創(chuàng)新型企業(yè)的發(fā)展戰(zhàn)略，了解申報(bào)企業(yè)是否將高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入作為主要的業(yè)績考核指標(biāo)。

高新審計(jì)依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定辦法相關(guān)規(guī)定，企業(yè)申請高新認(rèn)定，需要對近三年的財(cái)務(wù)狀況、研發(fā)費(fèi)用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入情況進(jìn)行審計(jì)，出具審計(jì)專項(xiàng)報(bào)告和年度審計(jì)報(bào)告。

會(huì)計(jì)師會(huì)結(jié)合企業(yè)情況，給出一份準(zhǔn)備材料的清單。主要是企業(yè)的資產(chǎn)負(fù)債表、損益表、總賬、明細(xì)賬、科目余額表(到末級科目)、財(cái)務(wù)憑證、公司的執(zhí)照、章程等等。