高新技術(shù)企業(yè)認定審計肯定是在高新技術(shù)企業(yè)的基礎(chǔ)上才能去操作的，所以，想要申報高新技術(shù)企業(yè)認定審計，首先需要認定企業(yè)為高新技術(shù)企業(yè)。一定要先認定為高新技術(shù)企業(yè)，才能申報高新技術(shù)企業(yè)認定審計。

申報明細表又區(qū)別于年度財務(wù)報表。企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表和近一年高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細表是按照《高新技術(shù)企業(yè)認定管理辦法》和《高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作指引》編制的，其列報的數(shù)據(jù)可以直接反映出企業(yè)是否滿足認定條件。

無論是研究開發(fā)費用，還是高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))，在專項審計中都涉及高新技術(shù)的識別。注冊會計師不是高新技術(shù)領(lǐng)域的專家，《專項審計指引》為此做了如下規(guī)定：

(1)恰當(dāng)界定研究開發(fā)項目、高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))的具體范圍是申報企業(yè)的責(zé)任。

(2)申報企業(yè)技術(shù)負責(zé)人與企業(yè)法定代表人、財務(wù)負責(zé)人共同簽署《管理當(dāng)局聲明書》。

但《專項審計指引》也規(guī)定，制定總體審計策略時，應(yīng)當(dāng)清楚地說明向具體審計領(lǐng)域調(diào)配的資源，包括就復(fù)雜的研究開發(fā)項目技術(shù)問題利用專家的工作。

高新審計依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認定辦法相關(guān)規(guī)定，企業(yè)申請高新認定，需要對近三年的財務(wù)狀況、研發(fā)費用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入情況進行審計，出具審計專項報告和年度審計報告。

會計師會結(jié)合企業(yè)情況，給出一份準備材料的清單。主要是企業(yè)的資產(chǎn)負債表、損益表、總賬、明細賬、科目余額表(到末級科目)、財務(wù)憑證、公司的執(zhí)照、章程等等。