北京301醫(yī)院先后獲得省部級以上科技成果獎勵1300余項，其中，國家科技進(jìn)步一等獎7項，二等獎22項，國家發(fā)明獎3項，軍隊科技進(jìn)步一等獎21項。醫(yī)院承擔(dān)“973”、“863”等各類課題800多項，在中國國內(nèi)、國際公開發(fā)表的論文總數(shù)和國內(nèi)論文被引用次數(shù)連續(xù)4年居全國醫(yī)院之首。

令狐恩強為中國逆行胰膽管造影（ERCP）規(guī)范的出臺做出了積極的貢獻(xiàn)，為中國消化道早癌的內(nèi)鏡下技術(shù)的完善與普及做了大量工作，為中國的內(nèi)鏡下早癌切除躋身世界先進(jìn)行列做出了積極的貢獻(xiàn)。

令狐恩強說，在2010年前后，我國提出消化內(nèi)鏡診治新模式的概念，來踐行早診早治的理念。一方面是把檢查切入點從有癥狀期提前到無癥狀期，另一方面則是形成以消化內(nèi)鏡治 療為主，外科手術(shù)切除為輔，放化療為補充的一套全新的治 療概念。該理念保證了患者能在早期就能被發(fā)現(xiàn)，并進(jìn)行有效的內(nèi)鏡下治 療，具有良好的社會意義和經(jīng)濟效益。

與外科手術(shù)比較，消化內(nèi)鏡技術(shù)便是一種超級微創(chuàng)醫(yī)療技術(shù)。隨著臨床醫(yī)學(xué)與迅速發(fā)展的光機電信息科學(xué)、材料科學(xué)以及生物工程科學(xué)等領(lǐng)域高新技術(shù)的有機結(jié)合，有越來越多的手術(shù)在內(nèi)鏡下完成，進(jìn)而成為消化道疾病的常規(guī)方法。