北京空 軍總醫(yī)院主要承擔(dān)空 軍飛行人員航空病、常見病診療防治研究及醫(yī)學(xué)鑒定任務(wù)；承擔(dān)預(yù)備航天員的體檢選拔任務(wù)；承擔(dān)空 軍部隊(duì)及聯(lián)勤部隊(duì)官兵的健康保障和疾病救治；還面向人民群眾提供優(yōu)質(zhì)醫(yī)療服務(wù)。已發(fā)展成為一所集醫(yī)療、教學(xué)、科研和預(yù)防保健為一體的大型現(xiàn)代化綜合性三級(jí)甲等醫(yī)院。
北京空 軍總醫(yī)院學(xué)科設(shè)置齊全，擁有50多個(gè)臨床、醫(yī)技科室，擁有皮膚科、中西醫(yī)結(jié)合正骨科、中醫(yī)科3個(gè)國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科和專科、專病中心，1個(gè)全軍皮膚病研究所，8個(gè)全軍醫(yī)學(xué)?？?、專病中心，1個(gè)國(guó)家臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)及全軍臨床藥理基地，設(shè)有飛行學(xué)員醫(yī)學(xué)選拔中心及一批特色學(xué)科。
北京空 軍總醫(yī)院共編設(shè)50多個(gè)臨床、醫(yī)技科室，展開床位1500多張，年門診量200多萬人次，收治量約4萬人次，手術(shù)1.8萬臺(tái)次。有空 軍級(jí)專家3人，空 軍高層次科技人才75人。擁有PET-CT、640排CT、高低場(chǎng)核磁、2微米激光腔鏡治 療系統(tǒng)等高 端科研醫(yī)療設(shè)備。
北京空 軍總醫(yī)院現(xiàn)有3個(gè)國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科（皮膚病重點(diǎn)學(xué)科、脊柱軟傷?？坪痛x病重點(diǎn)?？疲?、3個(gè)軍隊(duì)臨床重點(diǎn)?？疲谇?、皮膚、航空臨床醫(yī)學(xué)）、8個(gè)全 軍醫(yī)學(xué)?？疲▽２。┲行模ㄅR床航空醫(yī)學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合正骨、半匹配骨髓移植、腫瘤放療、小腸疾病內(nèi)鏡診治、泌尿微創(chuàng)診療、優(yōu)生優(yōu)育技術(shù)指導(dǎo)、心理技術(shù)指導(dǎo)中心）、18個(gè)專業(yè)實(shí)驗(yàn)室，主要面向全軍承擔(dān)特殊職業(yè)病研究、預(yù)防、診治和應(yīng)急支援保障任務(wù)，承擔(dān)招收飛行學(xué)員體檢和飛行人員航空醫(yī)學(xué)鑒定、訓(xùn)練任務(wù)及上級(jí)賦予的其他任務(wù)。
