北大醫(yī)院前身為北京醫(yī)科專門學(xué)校附設(shè)診察所，后陸續(xù)更名為北京醫(yī)科大學(xué)校附屬醫(yī)院、北平大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院等。1946年，醫(yī)院隨北平大學(xué)醫(yī)學(xué)院并入北京大學(xué)，由此得名“北大醫(yī)院”。1952年，全國(guó)高等學(xué)校院系調(diào)整，北京大學(xué)醫(yī)學(xué)院獨(dú)立建院，設(shè)立北京醫(yī)學(xué)院，后又更名為北京醫(yī)科大學(xué)，醫(yī)院隨之先后更名為北京醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院、北京醫(yī)學(xué)院第 一醫(yī)院、北京醫(yī)科大學(xué)第 一醫(yī)院。2000年，北京大學(xué)與北京醫(yī)科大學(xué)再次合并，醫(yī)院隨之更名為“北京大學(xué)第 一醫(yī)院”。2008年，醫(yī)院成為中央保健基地醫(yī)院。

北大醫(yī)院因醫(yī)學(xué)教育而生，始終堅(jiān)持“立德樹人”根本任務(wù)。自1977 年至今，醫(yī)院累計(jì)培養(yǎng)本科生 3300 余人，研究生 4000 余人，其中包括碩士 2000余人、博士 2000余人。作為首批國(guó)家住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)示范基地，自2005年至今，累計(jì)規(guī)范化培訓(xùn)住院醫(yī)師1100余人?，F(xiàn)有本科生同期在院440余人，研究生同期在院740余人，畢業(yè)后繼續(xù)教育900余人。

北京大學(xué)第 一醫(yī)院設(shè)有20個(gè)教研室、18個(gè)住培基地、35個(gè)專培基地，現(xiàn)有博士學(xué)位授予二級(jí)學(xué)科24個(gè)、碩士學(xué)位授予二級(jí)學(xué)科24個(gè)，是國(guó)家臨床教學(xué)培訓(xùn)示范中心、國(guó)家住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)示范基地。醫(yī)院推動(dòng)教學(xué)創(chuàng)新，以培養(yǎng)臨床醫(yī)學(xué)生勝任力為導(dǎo)向，開展器官系統(tǒng)整合的課程體系創(chuàng)新，PBL、模擬教學(xué)等教學(xué)方法創(chuàng)新，形成性評(píng)價(jià)、ePortfolio等評(píng)價(jià)模式創(chuàng)新。

北大醫(yī)院堅(jiān)持科技是第 一生產(chǎn)力，創(chuàng)新是第 一動(dòng)力，以新質(zhì)生產(chǎn)力引領(lǐng)高質(zhì)量發(fā)展?，F(xiàn)有國(guó)家皮膚與免疫疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心1個(gè)，國(guó)家衛(wèi)生健康委重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)，教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)，國(guó)家藥監(jiān)局重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)，北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室5個(gè)。是國(guó)家臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)、國(guó)家醫(yī)療器械臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)和第 一批北京市研究型病房示范建設(shè)項(xiàng)目單位，擁有臨床試驗(yàn)專業(yè)34個(gè)，醫(yī)療器械臨床試驗(yàn)專業(yè)26個(gè)。