曾學軍教授在多項首發(fā)基金連續(xù)十年支持下開展大型綜合醫(yī)院與社區(qū)醫(yī)療機構合作模式的研究。2005年始主持《社區(qū)中老年人健康管理規(guī)范》的制訂和推廣，成為國家公共衛(wèi)生規(guī)范項目之一，并于2015年成為國家推薦標準。

近年來，得益于國家對風濕免疫病投入逐步增加，在SLE科技支撐計劃/863項目、自身免疫性疾病新藥臨床評價研究技術平臺科技重大專項、衛(wèi)計委行業(yè)科研專項等支持下，以北京協和醫(yī)院牽頭，聯合全國近800家風濕病診治中心，已初步形成系統性紅斑狼瘡研究協作組（CSTAR）和國家風濕病數據中心（CRDC）的研究網絡，成為國內的風濕病研究協作組織，創(chuàng)建了中國風濕病信息數據庫、生物樣本庫（CRIP）和規(guī)范化培訓和多學科交流平臺（CREP），啟動了中國風濕病學界的多中心協作研究，發(fā)布了中國風濕病學界的規(guī)范化診治共識。

今天的北京協和醫(yī)院風濕免疫科，是醫(yī)療、教學、科研齊頭并進的科室典范，連續(xù)12年蟬聯復旦版《中國醫(yī)院?？坡曌u排行榜》風濕?？瓢袷?，連續(xù)9年在《中國醫(yī)院/中國醫(yī)學院?？萍剂恐担⊿TEM）》風濕病學與自體免疫病學中排名第 一，是中國風濕病學領域當之無愧的“領頭羊”。

北京協和醫(yī)院風濕免疫科從建科時僅有3張病床的小科室發(fā)展到今天，協和風濕免疫科已擁有68張病床，年收治患者1500例次以上，年門診量逾12萬人次，不僅注重系統性紅斑狼瘡、干燥綜合征、類風濕關節(jié)炎、強直性脊柱炎等常見風濕性疾病的規(guī)范診治，更強調對少見風濕性疾病、風濕性疾病重要臟器損害以及風濕性疾病嚴重并發(fā)癥的綜合診治，追求更精 確的診斷、更細致的評估、更有效的治 療效果。