醫(yī)院技術(shù)力量雄厚。擁有重點(diǎn)學(xué)科兒科學(xué)，國家兒童腫瘤監(jiān)測中心、國家呼吸系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心、國家中西醫(yī)協(xié)同旗艦醫(yī)院試點(diǎn)單位等12個平臺，8個國家臨床重點(diǎn)?？?，5個北京市重點(diǎn)實驗室，2個北京市級研究平臺以及16個市級醫(yī)療中心。醫(yī)院設(shè)有疑難罕見病例會診中心和遠(yuǎn)程會診中心，兒科疑難重癥疾病的診斷水平居國內(nèi)地位，是中華醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會、兒外科分會，中國醫(yī)師協(xié)會小兒外科醫(yī)師分會，中華護(hù)理學(xué)會兒科專業(yè)委員會主任委員單位。

北京兒童醫(yī)院積極發(fā)揮學(xué)科作用，領(lǐng)航兒科行業(yè)發(fā)展。2013年牽頭組建北京兒童醫(yī)院集團(tuán)，創(chuàng)新“病人不動、醫(yī)生移動”的模式服務(wù)全國患兒，目前理事單位成員已達(dá)57家。醫(yī)院與美國、俄羅斯、加拿大、意大利、澳大利亞、瑞典、德國、法國、日本、新加坡等國家的兒童醫(yī)療機(jī)構(gòu)和科研院所建立了良好的關(guān)系和廣泛的合作，是科技部認(rèn)定的兒童重大疾病國際科技合作基地。

2001年，在胡亞美院士和吳敏媛教授的直接領(lǐng)導(dǎo)下，成立北京兒童醫(yī)院血液病中心造血干細(xì)胞移植專業(yè)組，是國內(nèi)早系統(tǒng)開展兒童造血干細(xì)胞移植工作的中心之一。2021年，在原有血液腫瘤中心干細(xì)胞移植病房基礎(chǔ)上，成立了北京兒童醫(yī)院干細(xì)胞移植科，同年 6月，干細(xì)胞移植科在北京兒童醫(yī)院保定醫(yī)院，成立了我國北方、保定的兒童造血干細(xì)胞移植中心，現(xiàn)干細(xì)胞移植科分為2個病區(qū)，北京病區(qū)（本部）和保定病區(qū)， 2個病區(qū)共20間百級移植倉，6間千級移植倉，2個干細(xì)胞采集室，1個干細(xì)胞實驗室，每年進(jìn)行150-250例造血干細(xì)胞移植，是目前我國北方的兒童造血干細(xì)胞移植中心，秦茂權(quán)帶領(lǐng)其團(tuán)隊分別長駐北京和保定同時開展干細(xì)胞移植工作，保證及管理的同質(zhì)化。

科室團(tuán)隊擁有18名醫(yī)師，1名助理研究員，其中碩士研究生導(dǎo)師1人，副高級以上職稱9人，中級職稱6人。其中博士后1人，具有博士學(xué)位者5人。

團(tuán)隊成員先后承擔(dān)國家自然科學(xué)基金2項，北京市自然科學(xué)基金2項，教育部博士點(diǎn)基金1項；1人入選北京市人才青年拔尖計劃(高創(chuàng)計劃)，1人入選國家外專局培訓(xùn)計劃，2人入選北京兒童醫(yī)院苗圃計劃；1人科研成果入選“北京市自然科學(xué)基金十二五期間成果選編”。團(tuán)隊成員共發(fā)表作者SCI論著多篇，參與編寫書籍多部及指南/專家共識多篇。

科室秉承全心全意服務(wù)于移植患兒的原則，建立移植病人檢查綠色通道，短時間完成檢查并開始，精益求精，為患兒得到質(zhì)的醫(yī)療服務(wù)和的療效而不斷努力！