健康證主要適用于食品、飲用水生產經營人員、直接從事化妝品生產的人員、公共場所直接為顧客服務的人員、有害作業(yè)人員、放射工作人員等特殊行業(yè)的從業(yè)人員。

入職體檢報告是一般非餐飲行業(yè)和食品制造業(yè)的職員入職辦理的。健康證的體檢需要增加肛拭和轉氨酶指數這兩個項目，但是入職體檢不需要。

持有健康證可以從事大部分行業(yè)，但持有普通的入職體檢報告不能從事健康證適用范圍的特殊行業(yè)職業(yè)。