1999年經廣東省機構編制委員會批準在廣東省微生物研究所的基礎上加掛成立廣東省微生物分析檢測中心，并于當年通過計量認證（CMA），具有獨立法人地位和第三方實驗室地位。2004年通過中國實驗室國家認可委員會（CNAL）認可，檢測數據可獲得國際互認，成為可為社會提供用于貿易出證、產品質量評價、成果鑒定的公證數據的合法檢測機構，具有法律效力。 檢測中心按照ISO/IEC17025：2005建立了完善的管理體系，技術力量雄厚，檢測設備齊全。檢測中心自成立以來，業(yè)務遍及全國，具有很高的知名度和影響力。檢測中心的科技人員積極跟蹤國內外相關行業(yè)的國際標準、國家標準的制定、修訂的發(fā)展情況，主持和參與了五十多項國家標準、行業(yè)標準、地方標準的制修訂工作。 檢測中心現為國家認監(jiān)委認可的符合良好實驗室規(guī)范(GLP)原則的實驗室、環(huán)境保護部公告的提供新化學品測試數據的檢測機構、農業(yè)部批準的農藥登記環(huán)境試驗單位、“全國危險化學品管理標準化技術委員會化學品毒性檢測分技術委員會 (SAC/TC251/SC1)” 聯合秘書處掛靠單位；全國衛(wèi)生產業(yè)企業(yè)管理協會產業(yè)分會“標志產品”性能和中國針織工業(yè)協會針織品的性能指定推薦檢驗機構、中日兩國“互認”指定推薦檢驗機構、廣東省輕工協會—香精香料化妝品洗滌用品專業(yè)分會推薦的微生物檢驗機構、第十六屆亞運會公共衛(wèi)生檢驗檢測合作實驗室、中環(huán)聯合（北京）認證中心有限公司“環(huán)境標志產品”檢驗簽約實驗室、廣州寶潔有限公司微生物專業(yè)合同實驗室。 經國家發(fā)改委立項建成“廣州國家生物產業(yè)基地生物新技術及產品研究開發(fā)和測試公共實驗中心”、“廣州化學品生態(tài)環(huán)境評價服務中心”；經廣東省科技廳批準，作為主要承擔單位聯合組建“廣東省食品檢測與評價科技創(chuàng)新平臺”、作為參加單位組建“廣東省材料檢測與評價科技創(chuàng)新平臺”的材料（制品）防霉及性檢測與評價中心。